Der Landesvorstand ist nach der Mitgliederversammlung (Landeskongress) das zweithöchste Entscheidungsgremium der Jungen Alternative Bayern. Er ist zuständig für alle politischen und organisatorischen Fragen des Landesverbandes. Zuletzt wurde der Landesvorstand der Jungen Alternative Bayern gewählt am 27. Januar 2024. Die Amtszeit dauert zwei Jahre.